Pelar y cortar las cebollas con una mandolina o un cuchillo. Derrite la mantequilla en una cacerola. Dorar las cebollas durante 5 minutos, revolviendo. Cuando estén dorados, espolvorear con harina y mezclar. Vierte el caldo. Salpimienta ligeramente. Agrega un poco de tomillo. Tapa y cocina por 30 minutos a fuego lento. Una vez cocida la sopa, divídela en 4 tazones aptos para el horno. Precalienta el horno a 210 ° C. Durante este tiempo, extiende el hojaldre sobre la superficie de trabajo y corta círculos un poco más anchos que tus tazones. Diluir la yema de huevo con un poco de agua. Cepilla los bordes de los tazones con esta preparación. Coloca los círculos de pasta en los tazones. Cepíllalos con la yema de huevo. Espolvorea el Emmental rallado. Espolvorear con semillas de amapola. Hornea por 15 minutos hasta que la masa se dore. Servir caliente.